Creación de un Atlas usando QGIS

El siguiente vídeo muestra el procedimiento de creación de un mapa de localización y posterior creación de un Atlas que representa el número de personas por municipio que asistieron a consulta por un diagnóstico de influenza o neumonía. El proceso culmina con la exportación del Atlas a un archivo PDF, luego de explorar todas las características personalizables en un Atlas.

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Mapa de calor con ArcGIS 10x

El siguiente vídeo muestra el procedimiento de creación de un mapa de calor en ArcGIS 10, partiendo de los datos de la epidemia de cólera que se presento en el Distrito de Soho, Londres en 1854 y que fue analizado por Jhon Snow y que le otorgó el título de padre de la epidemiología espacial.

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Creación de un mapa coroplético de influenza por Departamentos usando QGIS

El siguiente vídeo parte de los datos que se pueden descargar de sistema de información SISPRO del Ministerio de Salud y Protección Social y crear un mapa coroplético de los casos de influenza.

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Creación de un mapa coroplético por Departamentos usando QGIS

El siguiente vídeo parte de la descarga de datos de la página del DANE para crear un mapa coroplético de los departamentos de Colombia a través de su código.

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Evaluación Multi-Criterio (EMC) y los SIG

En la siguiente gráfica, Gómez y Barredo [1] exponen lo que consideran un sistema de integración entre SIG y EMC, basados en los antecedentes aportados por Eastman et al. [2], el mismo Barredo [3] y Malczewski [4] sobre las bases conceptuales de la EMC en el entorno SIG

Sistema de integración entre SIG y EMC. Fuente: Gómez y Barredo [1]

Este tipo de modelos y su aplicación siguen un modelo racional de toma de decisiones que Gómez y Barredo [1] agrupan en cinco grandes fases:

1. Definición del problema: Para la definición se parte de un estado actual y un estado deseado y la diferencia que se encuentre entre ambos se formula como un problema de decisión.
2. Búsqueda de alternativas: Se plantean alternativas o potenciales soluciones al problema y se establecen los criterios mediante los cuales se evaluarán dichas alternativas.
3. Evaluación de alternativas: Se calcula el nivel de adecuación e impacto para cada alternativa según el punto anterior.
4. Selección de alternativas: Se ordenan las alternativas de la más deseable a la menos deseable y se realiza la selección final.
5. Análisis de Sensibilidad: Se realizan modificaciones sobre los componentes del modelo para comprobar que tan estable es el proceso y como se altera el resultado final con estas alteraciones.

[1] Gómez, M., & Barredo, J. (2006). Sistemas de información geográfica y evaluación multicriterio en la ordenación del territorio (2 Ed. ed.). Madrid, España: Ra-Ma.
[2] Eastman, J., Kyem, P., Toledano, J., & Jin, W. (1993). Gis and Decision Making. United Nations Institute for Training and Research (UNITAR).
[3] Barredo, J. (1996). Sistemas de Información Geográfica y Evaluación Multicriterio en la ordenación del territorio. Madrid: Ra-Ma.
[4] Malczewski, J. (1999). GIS and Multicriteria Decision Analysis. New York: John Wiley & Sons, Inc.

Análisis Exploratorio de Datos Espaciales (ESDA) en la Geografía de la Salud

Desde sus inicios en 1997 cuando John W. Tukey propuso el análisis exploratorio de datos (EDA por sus siglas en ingles) como método dentro de la estadística descriptiva, sus aplicaciones se han expandido por muchas áreas, incluyendo la geografía de la Salud.

Las técnicas del EDA permiten realizar un estudio inicial de los datos para mostrar resultados gráficamente o a manera de resumen, que permitan al investigador contar con información estructural del comportamiento de cada variable, así como las relaciones existentes entre ellas. Entre otras de sus aplicaciones están, ayudar en la identificación de errores en la codificación de los datos y determinar casos anómalos (outliers).

Para hablar del análisis exploratorio de datos espaciales (ESDA), partamos del trabajo de Howe (1985) que describe la salud como un sistema analítico que comprende cinco ramas: (1) biología humana, (2) ambiente, (3) forma de vida y (4) sistema de asistencia medica.

La Geografía Médica actual aborda básicamente la segunda línea considerando principalmente los factores externos al cuerpo humano que forman parte del entorno y de las cuales se pueden analizar diferentes distribuciones espaciales, la geografía de los servicios sanitarios aborda básicamente la cuarta línea considerando a los centros de atención médica como puntos de oferta de servicios a la población. Ambos son los grandes componentes de la Geografía de la Salud.

El ESDA, se aplica generalmente al estudio de las distribuciones espaciales de diagnósticos de enfermedades, características poblacionales y ambiente urbano, es por este motivo, que se orienta básicamente a los lineamientos de la Geografía Médica.

[1] Buzai, Gustavo D. (2015). "Análisis Espacial en Geografía de la Salud. Buenos Aires, Argentina. Lugar Editorial.

Poblaciones en Riesgo

Los SIG se están utilizando en estudios para modelar donde vive la gente y los entornos que experimentan a través de sus vidas.

Los SIG son una herramienta muy poderosa ya que los procesos económicos y sociales que estructuran el desarrollo residencial, la edad, el sexo y al etnia de la población, no son uniformes a través de las regiones, asentamientos o incluso barrios.

Los SIG pueden ser usados para hacer mapas convencionales de la distribución de la población, pero de igual manera, pueden mostrar mapas que describan la localización de los edificios donde la vive la gente para obtener un mayor nivel de detalle.

(1) Población de la ciudad de Bogotá para el año 2017 según proyecciones
del DANE. (2) Detalle a nivel de manzanas y edificaciones.
Elaboración propia utilizando ArcGis for Desktop 10.4

La distribución de la población por residencia es quizás la distribución geográfica más frecuentemente utilizada en salud pública y epidemiología, sin embargo, la residencia no es el único factor a tener en cuenta. Para (Gollerde & Stimson, 1997) el término "espacio de actividad" que hace referencia al área donde la persona pasa su tiempo, es muy importante, ya que representa la zona donde el individuo esta expuesto a riesgos o recursos.

Como adición al modelamiento de la distribución de la población, los SIG están analizando los diarios de viajes y la representación de estos espacios de actividad. Este tipo de análisis permiten por ejemplo, tener un mejor entendimiento del fenómeno de la migración, que hace que los individuos que se relocalizan permanente o semipermanentemente fuera de su espacio de actividad, estén expuestos a un nuevo conjunto de riesgos [1].

[1] Cromeley, E., McLafferty, S. (2002). "GIS and Public Health" (First Edition). New York. The Guilford Press.

Fundamentos Geográficos en Salud Pública

Para Ellen K. Cromley y Sara L. McLafferty en su libro "GIS and Public Health", el fundamento de la geográfica en la salud publica parte de la pregunta "¿dónde?": ¿dónde vive la gente?, ¿dónde están los agentes de las enfermedades?, ¿dónde podemos intervenir para eliminar riesgos o mejorar la prestación de los servicios de salud?. Las personas y los factores que causan las enfermedades están dispersados, a menudo de forma desigual, a través de comunidades y regiones. El proceso que pone en contacto a las personas con agentes patógenos también es geográficamente variable.

Para la Organización Mundial de la Salud (OMS) "La salud es un estado de completo bienestar físico, mental y social, y no solamente la ausencia de afecciones o enfermedades". Debido a que la gente esta afectada por sus entornos, en salud uno de estos entornos es el contexto geográfico, que esta conectado con procesos naturales, sociales y económicos que operan a nivel local, regional y a escala global.

El comportamiento de la gente contribuye a su estado de salud, pero no podemos divorciar el comportamiento del entorno y el contexto social en donde este ocurre. También es importante recordar que no todos los factores que afectan el bienestar están directamente bajo el control del individuo, sin embargo, el entorno de la persona es un punto de inicio para los SIG en salud pública [1].

[1] Cromeley, E., McLafferty, S. (2002). "GIS and Public Health" (First Edition). New York. The Guilford Press.

El padre de la epidemiología espacial

John Snow (1813-1858) fue un brillante médico inglés. Desde temprana edad destacó por su agudo sentido de observación, razonamiento lógico y perseverancia, primero en el ámbito de la anestesia y posteriormente en epidemiología. Los sucesivos brotes de cólera que afectaron a la ciudad de Londres, lo motivaron a estudiar esta enfermedad desde un punto de vista poblacional, relacionando la incidencia de casos al consumo de aguas contaminadas por una “materia mórbida”, responsable de la diarrea aguda con deshidratación que la caracteriza. En forma valerosa, Snow se opuso a las teorías vigentes de su época, sacrificando su prestigio. Fue pionero en el uso de metodologías de investigación epidemiológica moderna, por ejemplo, ha implementación de encuestas y la epidemiología espacial. Con justa razón, hoy en día es considerado por la comunidad científica como el padre de la epidemiología moderna [1].

Mapa confeccionado por John Snow de las muertes por cólera ocurridas en el área de Broad Street. La bomba de agua se ubica en la intersección de Broad y Cambridge Street. Los puntos son casos de cólera durante la epidemia en Londres de 1854 y Las cruces la ubicación de las bombas de agua [2].

Fuente imagen John Snow: De The original uploader was Rsabbatini de Wikipedia en inglés - [1] Originally from en.wikipedia; description page is/was here., CC BY 4.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=403227
[1] J. Cerda y G. Valdivia, "John Snow, la epidemia de cólera y el nacimiento de la epidemiología moderna", Rev Chil Infect 2007; 24 (4): 331-334, disponible en: http://www.scielo.cl/pdf/rci/v24n4/art14.pdf 
[2] Dominio público, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=403247

Sistemas de información geográficos y su aplicación en Salud

Los sistemas de información geográficos (SIG) proveen un camino efectivo hacia la visualización, organización, y gestión de una amplia variedad de información en cualquier ámbito de estudio, yendo desde análisis simples hasta muy complejos.

El área de la salud no ha sido ajena a esta revolución, que ha visto como en los últimos 20 años, el desarrollo y evolución de los SIG y de las técnicas de análisis espacial han provocado nuevas formas de almacenar, analizar y representar dicha información.

Producto de esta revolución, los estudios e investigaciones que se han realizado alrededor de la información geográfica en el mundo no son pocos y han arrojado datos importantes sobre el estado de salud de la población mundial en temas críticos como el VIH, el cáncer de seno, la obesidad, enfermedades transmitidas por vectores, el acceso a los servicios de salud en regiones apartadas entre muchos otros.